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目的 Dof(DNA binding with one finger)家族是高等植物中特有的一类转录因子家族,参与植物中光、激素、非生物胁迫等多种胁迫响应调控。本研究基于全基因组数据对黄花蒿Dof(AaDof)转录因子家族进行鉴定及表达模式分析,探究Dof家族基因在青蒿素合成调控中的作用。方法 经PFAM数据库鉴定获得AaDof序列,通过生物信息学软件分析其理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白保守结构以及启动子序列结合元件等,并基于赤霉素(Gibberellic acid, GA)、紫外线B(UV-B)及二者协同胁迫下黄花蒿转录组数据对其表达模式进行分析。结果 本研究从全基因组水平共鉴定出51个AaDof基因,均含有保守的C2-C2单锌指结构,依据系统发育分析分为8个亚族,同一亚族内基因结构与蛋白保守结构域相对保守。亚细胞定位预测显示12个AaDof蛋白定位在细胞外,其余均定位在细胞核。启动子元件分析发现AaDof家族基因启动子区富含光、激素等多种响应元件。对AaDof在GA、UV-B和GA+UV-B处理下的表达模式分析发现,AaDof基因对GA胁迫处理响应较弱,仅有少量基因敏感,其表达主要受到UV-B胁迫影响。C1及C2.1亚族大部分基因在UV-B胁迫下上调表达,而A亚族大部分基因在UV-B胁迫下下调表达。qRT-PCR验证表明AaDof1AaDof17AaDof44在GA和UV-B处理下表达量显著上调,推测其可能通过参与GA和UV-B调控网络,正向调控青蒿素生物合成。结论 本研究系统鉴定了黄花蒿AaDof家族基因并筛选了3个可能正向调控青蒿素生物合成的候选AaDof基因,为黄花蒿Dof家族基因功能研究及其在青蒿素生物合成中的调控机制解析奠定基础。  相似文献   
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Wu  Han-Biao  Xiao  Yu-Gang  Chen  Ji-Sheng  Qiu  Zhi-Kun 《Metabolic brain disease》2022,37(5):1609-1639
Metabolic Brain Disease - Bupleurum chinense DC. (Chaihu) is a traditional Chinese medicine (TCM) used in the treatment of anxiety. But the anxiolytic mechanisms of bupleurum are still unclear....  相似文献   
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目的 利用网络药理学方法探讨清金化浊方治疗慢阻肺的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)平台检索组方君臣药物的主要化学成分及作用靶点,通过TTD、CTD、DisGeNET、GeneCards数据库获得慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)相关靶点,筛选药物与疾病的交集靶点及有效活性成分。利用Cytoscape3.7.2构建药物-化合物-靶点-疾病网络,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用关系(Protein-Protein Interaction,PPI)网络 拓扑分析图,并分析核心靶点。利用DAVID数据库进行基因功能(Gene Ontology,GO)和基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,并绘制通路-靶点网络图。基于网络分析结果,纳入2020年1月-2021年1月我科收治的AECOPD患者,采用区组随机法按1:1分为对照组(西医治疗组)、研究组(清金化浊方联合西医治疗组),比较两组患者的IL-6、TNF-α水平。结果 筛选得到164个中药成分靶点,3051个COPD靶点,映射得出药物-疾病交集靶点112个。分析得出清金化浊方治疗COPD主要有槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、豆甾醇、木犀草素等有效活性成分,涉及IL-6、TNF、MAPK3、VEGFA、TP53、PTGS2、MAPK1、PIK3CG等关键靶点。富集于药物反应、一氧化氮生物合成过程的正调控、缺氧反应等生物过程及83条信号通路,其中TNF、HIF-1和PI3K-Akt信号通路在COPD的治疗中最为重要。临床研究显示,两组治疗7天后IL-6、TNF-α均较治疗前下降;治疗后组间比较,研究组低于对照组(P<0.05)。结论 清金化浊方主要以抗炎为核心,兼有调节氧平衡、降低气道黏液高分泌、改善气道重塑、调节免疫功能及血液高凝状态等多方面的作用,为其临床应用提供一定指导价值,亦为进一步开展后续课题研究提供科学依据。  相似文献   
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目的 了解主动脉夹层患者术前决策现状并分析其影响因素,为决策辅助方案构建提供参考。方法 在患者知情同意的基础上,采用一般资料调查表、决策参与量表、决策冲突量表对110例主动脉夹层患者进行调查。结果 主动脉夹层患者术前决策过程中,59例(53.64%)倾向于与医生共享决策,但实际参与过程中60例(54.54%)为被动决策。患者决策冲突得分45.91±9.30。多元逐步回归结果显示,并存疾病数量、婚姻状况、家庭月收入、以往就医体验、实际参与角色是主动脉夹层患者决策冲突的主要影响因素(P<0.05,P<0.01)。结论 主动脉夹层患者术前决策期望与实际参与存在差异,决策冲突处于高水平,且受多因素影响。医务人员应加强与患者的沟通,尊重患者决策偏好,以信息支持为基础构建决策辅助工具,为患者提供适当决策支持,降低决策冲突。  相似文献   
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